哈尔滨工程大学由国防科工委、海军、教育部、黑龙江省、国家海洋局 重点共建。学校原隶属于国防科工委，现隶属于工信部（由原国防科工委、信息产业部等合并而成），是国防七校、东北五校之一，是中国三海一核领域最大的高层次人才培养基地和重要的科学研究基地 ，是被国家授予“航母建设突出贡献奖” 的唯一获奖院校，2017年学校科研经费到款突破13亿元